Ekstraksi dan Pengolahan Informasi Genetik dari Database SWISS-PROT Menggunakan Apache Spark
Sedan början av livet på denna planet har fyra bokstäver styrt alla biologiska processer hos varje organism som någonsin har levt och dött: A, C, T och G. Dessa är de fyra nukleotidbaspar som hjälper till att komponera DNA och diktera vilken organism ser ut, hur den beter sig och vad dess ekologiska roll är i naturen. (Det finns också U i stället för T i RNA, för alla genetiska kompletterare där ute.)
Men tiderna är de en changin '. Stigningen i syntetisk biologi betyder inte längre att begränsas till bara fyra bokstäver för att göra DNA. Efter decennier av arbete har Steven Benner, en organisk kemist vid Foundation for Applied Molecular Evolution i Florida, äntligen utvidgat koden med nya brevordningar för att i grund och botten förbättra den. Och resultatet är två nya konstgjorda nukleotider: P och Z.
I två nyligen publicerade papper visar Benner och hans kollegor hur P och Z kan passa in i DNA: s spiralformiga struktur och bidra till att upprätthålla den naturliga formen av genetiskt material. Ännu bättre, beter sig DNA med P och Z och - viktigast av allt - utveckla precis som normalt DNA. Benners arbete på P och Z skisseras i större detalj i Quanta Magazine.
Det är en praktisk fråga för varför att expandera det genetiska alfabetet från fyra till sex bokstäver är till hjälp. DNA hjälper till att koda aminosyror, som kan sättas ihop på miljontals sätt för att skapa proteiner som hjälper till att bygga oss som vi är och flytta våra biologiska processer framåt. Men nuvarande fyrbords alfabet kodar endast 20 aminosyror. Ett sex bokstavs alfabet kan emellertid koda 216 olika aminosyror och användas för exponentiellt mer olika proteinkonstruktioner.
Det finns massor av sätt att forskare skulle kunna använda det här nya sex-alfabetet "FrankenDNA" i genetiska och medicinska sysslor. Bennett andra papper beskriver hur våra DNA-sekvenser med P och Z kan selektivt binda till tumörceller. Denna observation kan hjälpa till att identifiera var cancervävnad kan ligga i kroppen. Möjligheten att syntetisera nya typer av proteiner kan också vara mycket användbar för att lösa många typer av forskningsfrågor om biologi och ge en fascinerande inblick i evolutionära processer.
Den största nackdelen är emellertid att fler nukleotidbokstäver skapar större chanser att fel uppstår i DNA. Att ha bara fyra olika nukleotider begränsar den typ av mutationer som kan inträffa och minskar kraftigt chansen att en mycket allvarlig eller dödlig mutation kommer att bildas. Även bara två ytterligare typer av nukleotider kan visa sig katastrofala när det gäller DNA-reparation och mutationskontroll.
Oavsett detta kommer det säkert inte vara sista gången vi kan förvänta oss att nya nukleotider kommer in i DNA. Syntetisk biologi börjar bara komma ur marken.
Alfabetet är nu det värsta företaget i världen
Google - eller Alphabet, Inc., Googles moderbolag - ska inte överträffas av någon eller något annat. Det är nu mer värdefullt än något annat offentligt handlade företag på planeten och slår Apple. CFO, Ruth Porat, talar om miljarder som du och jag talar om enkla dollarräkningar. Och i sitt kvartalsvinst kallar du på ...
Syntetiska diamanter är billiga och falska. Det är bra saker.
Syntetiska pärlor är nu så som naturstenar, juvelerare uppfinnar maskiner för att skilja mellan dem. Det bästa med det här är att det äntligen ger den sista fasaden av värdet av den naturliga diamanthandeln, och lämnar ingenting annat än en vulgär loppmarknad byteshandel mellan fåfänga och elände. Minst en fjärdedel av alla d ...
Hemligheten att åldras bättre kan vara lika enkel som tre bokstäver: NAD +
Elysium Health har släppt ett nytt tillskott som heter Basis som kan hjälpa din kropp att hålla sig frisk när du ålder. Enligt en dubbelblind, placebokontrollerad studie ökar tillägget kroppens nivåer av NAD +, vilket stöder viktiga aktiviteter inom våra celler och bidrar till vår hälsa.